Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sec22bO08547 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sec22bO08547 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms