Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r80L7N1Z3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vmn1r80L7N1Z3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms