Protein–RNA interactions for Protein: J3QNT6

Gm5039, Predicted gene 5039, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5039J3QNT6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5039J3QNT6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm5039J3QNT6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms