Protein–RNA interactions for Protein: J3QM67

Gm20825, Predicted gene, 20825, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20825J3QM67 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm20825J3QM67 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms