Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms