Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Gm21818J3KMS6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm21818J3KMS6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm21818J3KMS6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Gm21818J3KMS6 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm21818J3KMS6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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