Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gm20828J3KMI7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm20828J3KMI7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms