Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HrcG5E8J6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HrcG5E8J6 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HrcG5E8J6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HrcG5E8J6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms