Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trip12G5E870 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trip12G5E870 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms