Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc9a3G3X939 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc9a3G3X939 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms