Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trim55G3X8Y1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Trim55G3X8Y1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms