Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r76F8VQ63 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r76F8VQ63 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r76F8VQ63 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r76F8VQ63 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r76F8VQ63 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r76F8VQ63 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r76F8VQ63 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r76F8VQ63 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r76F8VQ63 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms