Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Colca2F8VPY8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Colca2F8VPY8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms