Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Usp9yF8VPU6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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