Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Farp1F8VPU2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms