Protein–RNA interactions for Protein: F7D1B3

4933402N22Rik, RIKEN cDNA 4933402N22 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402N22RikF7D1B3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4933402N22RikF7D1B3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms