Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
D430041D05RikF6ZGR6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
D430041D05RikF6ZGR6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms