Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm42421F6X8D5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm42421F6X8D5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms