Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm8247F6VRJ8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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