Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Zfp988F6VKC7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zfp988F6VKC7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Zfp988F6VKC7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Zfp988F6VKC7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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