Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
BC067074F6RXI4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms