Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
2610001J05RikF2Z3Y9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms