Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc74aE9Q9U8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc74aE9Q9U8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms