Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancfE9Q5Z5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FancfE9Q5Z5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms