Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
DspE9Q557 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
DspE9Q557 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms