Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gm3095E9Q058 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gm3095E9Q058 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms