Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chd2E9PZM4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chd2E9PZM4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms