Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brd1E9PZ26 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Brd1E9PZ26 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms