Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm3298E9PW80 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm3298E9PW80 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm3298E9PW80 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Gm3298E9PW80 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm3298E9PW80 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm3298E9PW80 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gm3298E9PW80 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm3298E9PW80 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Gm3298E9PW80 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Gm3298E9PW80 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3298E9PW80 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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