Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccdc144bE9PVZ3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ccdc144bE9PVZ3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms