Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc62E9PVD1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc62E9PVD1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms