Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc175E9PVB3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccdc175E9PVB3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms