Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vpreb3D3Z6J4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms