Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
5430403G16RikD3Z5L4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5430403G16RikD3Z5L4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms