Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trim12cD3Z3L3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trim12cD3Z3L3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms