Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
3425401B19RikD3Z1D3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
3425401B19RikD3Z1D3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms