Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc8D3YZV8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc8D3YZV8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 794 ms