Protein–RNA interactions for Protein: D3YYW9

1500009C09Rik, RIKEN cDNA 1500009C09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1500009C09RikD3YYW9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
1500009C09RikD3YYW9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms