Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930444P10RikD3YUR1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
4930444P10RikD3YUR1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms