Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4950D3YUM8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Gm4950D3YUM8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm4950D3YUM8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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