Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Nlrc5C3VPR6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Nlrc5C3VPR6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms