Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd8B9EJ80 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms