Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6133B2RY53 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6133B2RY53 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6133B2RY53 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6133B2RY53 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm6133B2RY53 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm6133B2RY53 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms