Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pnldc1B2RXZ1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pnldc1B2RXZ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms