Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cspp1B2RX88 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cspp1B2RX88 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms