Protein–RNA interactions for Protein: B2RT41

Zfc3h1, Zinc finger, C3H1-type-containing, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfc3h1B2RT41 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfc3h1B2RT41 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfc3h1B2RT41 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zfc3h1B2RT41 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zfc3h1B2RT41 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms