Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Znf518aB2RRF6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Znf518aB2RRF6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms