Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Znf518bB2RRE4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf518bB2RRE4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms