Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm2012B1B0R1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm2012B1B0R1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms