Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CK137956B1AYM9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms